威震天宣布了停止对地球的进攻，擎天柱出面与人类军方交涉，并举行了多国元首会议，说明了联手对付赛博坦上出现的怪兽的事情。
这场会议争执不断，恨意滔天的人类自然不愿意与赛博坦合作，不愿意帮助赛博坦，甚至不相信擎天柱说的话，觉得他也是为了赛博坦的缓兵之计。
当然，会议的最后还是少数服从多数，通过了决议，与变形金刚建立合作，共同对付赛博坦上的危机，而作为条件，赛博坦将会帮助地球发展科技，包括武器和星际飞船等等，以此来借助人类的资源和力量，迅速造出更多可以投入战斗的武器。
而且狂派变形金刚将永不再对地球实施军事入侵，并尽快带着赛博坦离开太阳系。
其实，这只是其中一条剧情线，这最终隐藏剧情其实拥有很多不同的支线，也会呈现出不同的结局，任务推进过程中，玩家将会面临好几次选择。
这些选择虽然是不同的任务，但却直接影响剧情的走向和擎天柱等主要角色的选择。
比如傲风他们可以选择帮助人类反对合作那一方阵营，按照他们的计划，将上万颗核武器送入赛博坦内部，用核武器直接将赛博坦摧毁，当然这个办法也会导致地球大部分地区都会遭受核污染。
擎天柱也可能会受到玩家的选择，而改变自己的选择，比如他可能会如曾经那样，彻底放弃赛博坦，选择发动了赛博坦引擎，让它向着远离地球的方向驶去，任由他自生自灭。
不同的选择必然会导致不同的结局，虽然傲风他们还没有将任何一条线玩到结局，但已经不难看出，这部分剧情是多线多结局的剧情。
玩家们又一次可以左右剧情的走向，决定赛博坦和地球人类的命运，而这又一次给所有玩家和变形金刚粉丝们带来了巨大的惊喜感。
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